蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

来自Zingiber Officinale Rosc的新型 III 型聚酮合酶的分子表征。及其生物信息学方法分析

III型聚酮合酶超家族在植物药用天然产物的生物合成中发挥着重要作用。PKS 通过改变其对起始分子的偏好、催化的乙酰基加成数量以及聚酮化合物中间体的环化来产生多样性的聚酮化合物衍生物。姜辣素和生姜相关化合物(姜科,Zingiber officinale Rosc.)令人惊奇的结构特征为了解新型 PKS 的存在提供了基因组见解。目前的研究描述了使用基于简并寡核苷酸的 PCR 方法从 Z. officinale 中分离和表征新型 PKS。重组ZoPKS在大肠杆菌中的诱导表达导致形成分子量约为43kD的蛋白质。ZoPKS 的比较序列和系统发育分析显示其与已鉴定的 PKS 存在显着差异。基于同源模型的比较结构生物信息学分析进一步证实了ZoPKS的新颖性。研究中鉴定出的新型 PKS 在决定起始底物选择性和缩合反应的关键残基上具有非常显着的氨基酸取代,并形成了来自 Z. officinale 的 PKS 的基因组基础,以探索其在姜辣素和相关化合物生物合成中的潜力。

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