临床微生物学与抗菌药物杂志

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铜绿假单胞菌临床菌株碳青霉烯酶编码基因的分子检测和测序

艾曼·卡迈勒·埃索维

2017年世界卫生组织(WHO)将碳青霉烯类耐药假单胞菌分类为是需要紧急关注的最关键的多重耐药细菌之一。在这项研究中,测试了基于 verigene 纳米球微阵列的测定和多重 PCR 来检测碳青霉烯编码基因。还对亲本菌株及其UV突变体进行了碳青霉烯酶编码基因测序,然后进行了核苷酸序列比对。通过十二烷基硫酸钠(SDS)和热处理诱​​导质粒固化后测试细菌对碳青霉烯类的耐药性。通过多重 PCR 在一个反应​​中检测到一组基因,包括 IMP、VIM 和 SME。Verigene-nanosphere在5、4、11个和先前确定的VIM、IMP、KPC基因阳性菌株中分别检测到3、0、0个。通过加热或 SDS 处理 CRPA 菌株后,碳青霉烯类耐药性得以保留。VIM的核苷酸序列比对,IMP 和 KPC 基因显示与许多革兰氏阴性物种相关。UV突变体中VIM基因丢失,IMP和KPC基因保留,但发生1-2%的序列修饰,但对亚胺培南和美罗培南的耐药性没有变化。总之,所开发的多重PCR成功检测到了一组碳青霉烯类编码基因,而基于verigene-纳米球的微阵列在当前实验条件下未能检测到大多数基因。VIM、IMP 和 KPC 基因的核苷酸比对表明,这些基因序列分布在革兰氏阴性细菌的物种之间。UV突变体中IMP和KPC基因得以保留,无损伤、损伤修复或核苷酸序列很少改变,同时碳青霉烯类抗性得以保留。UV突变体中VIM基因丢失,IMP和KPC基因保留,但发生1-2%的序列修饰,但对亚胺培南和美罗培南的耐药性没有变化。总之,所开发的多重PCR成功检测到了一组碳青霉烯类编码基因,而基于verigene-纳米球的微阵列在当前实验条件下未能检测到大多数基因。VIM、IMP 和 KPC 基因的核苷酸比对表明,这些基因序列分布在革兰氏阴性细菌的物种之间。UV突变体中IMP和KPC基因得以保留,无损伤、损伤修复或核苷酸序列很少改变,同时碳青霉烯类抗性得以保留。UV突变体中VIM基因丢失,IMP和KPC基因保留,但发生1-2%的序列修饰,但对亚胺培南和美罗培南的耐药性没有变化。总之,所开发的多重PCR成功检测到了一组碳青霉烯类编码基因,而基于verigene-纳米球的微阵列在当前实验条件下未能检测到大多数基因。VIM、IMP 和 KPC 基因的核苷酸比对表明,这些基因序列分布在革兰氏阴性细菌的物种之间。UV突变体中IMP和KPC基因得以保留,无损伤、损伤修复或核苷酸序列很少改变,同时碳青霉烯类抗性得以保留。总之,所开发的多重PCR成功检测到了一组碳青霉烯类编码基因,而基于verigene-纳米球的微阵列在当前实验条件下未能检测到大多数基因。VIM、IMP 和 KPC 基因的核苷酸比对表明,这些基因序列分布在革兰氏阴性细菌的物种之间。UV突变体中IMP和KPC基因得以保留,无损伤、损伤修复或核苷酸序列很少改变,同时碳青霉烯类抗性得以保留。总之,所开发的多重PCR成功检测到了一组碳青霉烯类编码基因,而基于verigene-纳米球的微阵列在当前实验条件下未能检测到大多数基因。VIM、IMP 和 KPC 基因的核苷酸比对表明,这些基因序列分布在革兰氏阴性细菌的物种之间。UV突变体中IMP和KPC基因得以保留,无损伤、损伤修复或核苷酸序列很少改变,同时碳青霉烯类抗性得以保留。
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