麻醉与临床研究
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抽象的

针对 SARSCoV-2 刺突蛋白和复制酶蛋白的计算机生成配体的分子对接和分析

Ifeanychukwu Okeke*、科斯马斯·奥克克

通过分子对接，将计算机生成的配体库与 SARS-CoV-2 刺突蛋白和复制酶蛋白对接，以识别具有高亲和力结合倾向的先导化合物。事实证明，所鉴定的先导化合物以比天然配体更强的亲和力结合这些蛋白质，有助于它们在体内的作用代谢过程。由此观察到刺突蛋白与其细胞受体结合，结合亲和力为-4.8 Kcal/mol；它以 -5.4 与非细胞类似物结合，而 4twy 3BL 和 5n19 D03 则以 -7.3 Kcal/mol 的结合亲和力结合刺突蛋白。它们还分别以-8.2和-7.2 Kcal/mol结合复制酶蛋白。研究结果表明，所鉴定的配体可以优先取代或抑制病毒蛋白与其天然内源配体的结合，并且仅使用所鉴定的一种物质即可抑制通过刺突和 ACE2 相互作用进行的细胞附着以及病毒复制过程。研究表明，5c8s G3A 和 2d2d ENB 被确定为最适合从生物样品中检测 SARS-CoV-2 刺突蛋白的先导化合物，体外和体内评估。