药物设计:开放获取

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开放获取

国际标准期刊号: 2169-0138

抽象的

使用WEBINA 1.0.3对合成三肽衍生物进行分子对接

R. Govindarajan1、Vissarapu Naga Lakshmi2*

计算机模拟方式在药物发现领域取得了具有惊人意义的地位。分子对接是一种广泛用于意外预测小分子与其目标分子(通常是蛋白质)的结合模式和亲和力的计算方法。计算机能力的急剧增长以及小分子和蛋白质数据库的可用性不断增加,极大地促进了分子对接。Webina 是一个 JavaScript/Web 汇编库,完全在互联网浏览器中运行 Autodock Vina(一种流行的分子对接软件)。对接计算在用户自己的计算机上进行,而不是在远程服务器上进行。Webina 网络应用程序包括一个方便的界面,因此用户可以轻松设置其对接运行并分析效果。该应用程序的运行模型可以免费访问。利用webina net服务器完成了18种合成肽衍生物与4FGW蛋白的分子对接研究。A2、A3、B1、B2 和 B3 一直表现出良好的活性。

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