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Deguelin及其衍生物与Cyclin D1和Cyclin E在癌细胞信号通路中的分子相互作用研究：计算方法

K·文卡特斯瓦拉·斯瓦米

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Deguelin 是多种植物的主要活性成分和主要成分，是靶向癌细胞信号通路蛋白的潜在分子。作为一种复杂的天然提取物，德桂林与各种分子靶点相互作用，在纳摩尔水平上发挥其抗肿瘤特性。它通过阻断抗凋亡途径诱导细胞凋亡，同时通过p27-cyclin-E-pRb-E2F1-细胞周期控制和HIF-1alphaVEGF抗血管生成途径抑制肿瘤细胞增殖和恶性转化。对德桂林及其衍生物进行计算机模拟研究，以探索与细胞周期蛋白 D1 和细胞周期蛋白 E 的相互作用，以了解衍生物与受体的分子见解。阿伏加德罗将德桂林及其衍生物最小化，以实现稳定的构象。所有对接模拟均使用 AutoDockVina 进行，并根据结合能和氢键数量对对接配体进行虚拟筛选。Cyclin D1 和 Cyclin E1 的分子动力学 (MD) 和模拟进行 100 ns，分​​别在 78 ns 和 19 ns 时获得稳定构象。从对接研究中获得的配体可能是抑制癌细胞信号传导途径的目标。