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使用 PCR-RFLP 进行分子分型揭示了科特迪瓦（西非）象牙海岸布鲁里溃疡环境分枝杆菌的多样性。

Quinet Gregoire、Kakou Ngazoa E Solange、Aka Nguetta、Vakou Sabine、Coulibaly Ngolo David、Kouakou Helene、Sylla Aboubacar、Faye-Kette Hortense、Aoussi Serge、Dosso Mireille

布鲁里溃疡是一种由溃疡分枝杆菌 (MU) 引起的被忽视的皮肤病，每年影响全世界 1000 人，特别是在非洲国家。由于农村流行地区缺乏早期诊断以及国家医疗保健系统对该病的了解，根除布鲁里溃疡很困难。在中非和西非的农村湿地和沼泽中，儿童受到的影响最为严重。MU属于环境产生分枝内酯的分枝杆菌（MPM），并且具有循环菌株的高度遗传多样性。通过培养和聚合酶链式反应（PCR）进行基因组检测来进行诊断。PCR 成为确认 MU 临床和环境样本的黄金方法。采用MIRU-VNTR方法和限制性片段长度多态性（RFLP）结合MIRU-VNTR标记来区分不同来源的分枝杆菌。本研究的目的是通过结合使用 MIRU-VNTRTtyping 和 RFLP 来研究来自环境、培养菌株和临床样本的不同分枝杆菌来源的分子多样性。来自流行地点的总共 26 个样本（水、沉积物、分枝杆菌菌株和拭子）首先通过 IS2404 或 Ziehl-Neelsen 染色进行了确认。通过 PCR 分型分析样品的 4 个特异性标记（MIRU-1、VNTR6、VNTR19、ST-1），并用 MspI 限制性内切酶消化扩增子，并通过 3% 琼脂糖凝胶电泳分离以进行 PCR-RFLP 分析。我们的结果显示 VNTR-MIRU 分型的不同扩增。对于环境样品，PCR-MIRU-1 检测到低扩增 25%。培养株和临床样本的扩增率分别为35.7%和62.5%。ST-1对培养菌株具有最好的扩增标记，扩增率为71.4%，而临床样本对所有标记都有良好的扩增率，扩增率为62.5%。临床样本的 PCR-RFLP 图谱相同，而环境菌株和分枝杆菌菌株则显示出不同的 PCR-RFLP 图谱。我们开发了一种 PCR-RFLP 敏感、更简单且廉价的方法来确认流行国家中非结核分枝杆菌的基因分型，以进行环境筛查。我们建议 VNTR-MIRU 序列的重复位点发生突变以及分枝杆菌从环境到人类的适应。这项研究证实了科特迪瓦存在多种基因型的分枝杆菌。