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使用免疫信息学方法预测苏丹埃博拉病毒的多表位肽疫苗

Ahmed Hamdi Abu-haraz *、Khoubieb Ali Abd-elrahman、Mojahid Salah Ibrahim、Waleed Hassan Hussien、Mohammed Siddig Mohammed、Marwan Mustafa Badawi 和 Mohamed Ahmed Salih

苏丹埃博拉病毒是单链负义RNA基因组，属于丝状病毒丝状病毒科，可引起出血热。目前尚无治疗方法或疫苗，因此本研究的目的是设计一种肽疫苗，利用免疫信息学方法分析所有SUDV毒株的糖蛋白，以确定保守区域，进一步研究该保守区域以预测所有可能的表位可用作肽疫苗。将从 NCBI 数据库检索到的总共 21 个苏丹埃博拉病毒糖蛋白进行比对，以确定保守性并使用 IEDB 分析资源预测表位。预测作为 B 细胞肽疫苗的三个表位（PPPPDGVR、ETFLQSPP、LQSPPIRE）。对于 T 细胞，四个表位对 I 类 MHC 显示出高亲和力（FLYDRLAST、IIIAIIALL、MHMQNALVC 和 RTYTILNRK）以及针对苏丹和全世界人口的高覆盖率。同样在 MHC II 类中，四个表位与最常见的 MHC II 类等位基因（FAEGVIAFL、FLRATTELR、FLYDRLAST 和 FVWVIILFQ）相互作用，对苏丹和全世界人口具有高覆盖率。我们建议进行体内和体外研究，以证明这些预测表位作为肽疫苗的有效性。