蛋白质组学与生物信息学杂志
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比较蛋白质组学对鼠疫耶尔森氏菌不同菌株的多元统计分析

托德·H·科泽特、安吉拉·M·埃尔德里奇、詹妮弗·S·纳克、克里斯托弗·H·科泽特、桑德拉·L·麦卡琴-马洛尼和布雷特·A·克罗米

为了解决在临床和环境样本中表征异常、工程或新出现的病原体的困难，需要新的方法来发现区分致病菌株的蛋白质。揭示未表征细菌菌株功能的差异表达蛋白可被视为生物标志物；这些组合可以改进病原体的分类和表征。为此，利用二维差异凝胶电泳（2-D DIGE）研究了鼠疫病原体鼠疫耶尔森氏菌的差异毒力分离株的蛋白质表达模式。由此产生的表征用于鉴定用于鼠疫耶尔森菌株聚类和分类的蛋白质表达组。使用两种不同的方法根据基于实验或基于模式的聚类产生不同的生物标记物组。每个小组都能够以盲法成功对未知样本进行分类，从而能够公正地发现差异表达的蛋白质，并对蛋白质表达模式进行快速分类。