免疫组学研究

免疫组学研究
开放获取

国际标准期刊号: 1745-7580

抽象的

浏览糖尿病相关免疫表位数据:免疫表位数据库 (IEDB) 提供的资源和工具

Kerrie Vaughan、Bjoern Peters、Roberto Mallone、Matthias von Herrath、Bart O. Roep 和 Alessandro Sette

背景:
免疫表位数据库(IEDB)最初专注于传染病,最近扩展到过敏、移植和自身免疫性疾病。在这里,我们重点关注糖尿病,它被选为自身免疫性疾病的原型。我们利用教程和荟萃分析相结合的形式,演示了如何回答与糖尿病表位相关的常见问题。
结果:
IEDB 中总共捕获了 409 个参考文献,描述了来自糖尿病相关抗原的超过 2,500 个表位。绝大多数数据来自GAD、胰岛素、IA-2/PTPRN、IGRP、ZnT8、HSP和ICA-1,与T细胞表位和MHC结合相关的实验远远超过B细胞检测。我们说明如何通过特定抗原、表位或宿主进行搜索。其他示例包括搜索受特定等位基因或感兴趣的测定限制的四聚体或表位,或根据宿主的临床状态进行搜索。
结论:
所有已发表的糖尿病表位数据的清单有助于科学界获取这些数据。虽然从文献中收集的主要数据反映了文献中存在的潜在研究偏差,但灵活的搜索方法允许用户根据自己的喜好执行查询,酌情包含或排除数据。此外,分析还强调了知识差距并确定了未来研究的领域。

Top