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抽象的

用于膜蛋白结构研究的新型类固醇两亲物

穆罕默德·埃赫桑

抽象的

本演讲将描述我们的合成生物学项目，指出利用微芯片寡核苷酸构建方块的多重高忠诚度质量混合物的平滑过程。该程序强调缩小规模、计算生物信息学配置、增强工作流程、低材料利用率、长且高排列精度、低错误DNA通过有效的创建过程而开发。特别是，我们的工作建立了一种直接且易于使用的流段技术（固定化纤维素限制性 mutS 片段），以从最后的寡核苷酸质量结构方块中排除包含错误的序列，这些序列被计划为可以通过以下方式处理：连接和 PCR 产生特征性的长 (kb) DNA。公布的工作流程需要大约一个小时的座位时间来处理寡核苷酸，每个 kb DNA 的错误率低于 1 个，这意味着全长 EGFP（720 bp）质量克隆的实现速度约为 80%。工作过程交出超过十种同等品质。具有在途径基因簇合成中应用的潜力。

膜蛋白允许细胞和细胞器及其外部环境之间存在可行的对应关系。在非本地条件下保持层蛋白的安全性是其基础研究的重大瓶颈。清洁剂通常用于从胶片中分离出层状蛋白质，并将分离的蛋白质保存在稳定状态以供下游描绘。在潮起潮落研究中，基于类固醇的两亲物、糖薯蓣皂苷元类似物（GDN）、基于类固醇的五糖的三种排列，要么缺乏连接子（SPS），要么有连接子（SPS-Ls）。被创建为用于膜蛋白研究的新型物质仪器。这些清洁剂与三种膜蛋白一起进行了试验，以展示它们从膜中提取层蛋白并长期平衡膜蛋白的能力。一部分新型清洁剂，尤其是 SPS-L，在尝试的薄膜蛋白方面表现出了良好的实践。这一结果证明了这些清洁剂作为层蛋白辅助检查的合成装置的可能用途，以及碱性烷基间隔基在决定清洁剂充足性方面的基本作用。

介绍

膜蛋白由大约 30% 的人类基因组编码，对于各种细胞功能至关重要。1 膜载体和通道指导物质交换，而膜受体负责信号转导和细胞间对应。由于这些在细胞生理学中的关键作用，层蛋白的功能障碍直接涉及广泛的人类疾病，因此它们是可能的恢复目标；大部分药剂学目标是膜蛋白。2 对这些蛋白质的基础和实用性研究肯定比溶剂蛋白的研究更麻烦，因为它们在非脂质条件下通常会完全或变性。脂质双层的平面工程对于蛋白质强度来说通常是合理的，因为与清洁剂胶束相比，该行动过程对薄膜蛋白质施加了更接地的水平重量。此外，一些膜脂质（例如胆固醇）与层蛋白表面明确连接，并在蛋白质功能中发挥作用。3-5 然而，为了下游描绘，必须将这些生物大分子从层中分离出来。沿着这些思路，我们需要一个层模拟框架来保护非局部条件下膜蛋白的局部结构。这些生物大分子必须从层中分离出来。沿着这些思路，我们需要一个层模拟框架来保护非局部条件下膜蛋白的局部结构。这些生物大分子必须从层中分离出来。沿着这些思路，我们需要一个层模拟框架来保护非局部条件下膜蛋白的局部结构。

具有球形或圆形设计的洗涤剂胶束普遍用作薄膜模拟框架。这些由具有锥形几何结构的两亲原子构成的自聚集体能够从膜上去除/溶解层蛋白。6这些两亲颗粒同样用于在整个蛋白质溶解、净化和结晶过程中保持目标蛋白质的结构和元素。在超过120种常规清洁剂中，只有几种清洁剂，例如正辛基-β-D-葡萄糖苷（OG）、正癸基-β -D-麦芽糖苷（DM）和正十二烷基-β-D-麦芽糖苷 (DDM)，通常用于膜蛋白操作。6 这些传统清洁剂通常包含一个单独的适应性烷基链和一个中等大小的头基。8 一些清洁剂，例如 3-[(3-胆碱基丙基)二甲基铵]-1-丙磺酸盐 (CHAPS) 和吐温排列与这种旧式设计明显不同，并且已知仅对少数层蛋白是合理的。9 膜蛋白甚至在主流清洁剂（例如 DDM）中也能溶解可能会在蛋白质提取和精炼过程中失去基本的诚实性，从而阻碍薄膜蛋白质研究的进展。由于膜蛋白在细胞工作中的多种作用以及特殊的 3D 结构，它们在工程和特性方面存在巨大差异。这种多变性并没有体现在传统的清洁剂中。各种层蛋白和可用于研究它们的物质工具中的巨大缺陷限制了膜蛋白的基础研究。因此，重要的是创造明确无误的新型两亲物，并提高膜蛋白调节的可行性。

结果与讨论

新试剂突出了基于类固醇的不弯曲的亲脂性聚集和基于淀粉的亲水性聚集。主要的新型清洁剂是含有薯蓣皂苷元作为亲脂性聚合物和两种麦芽糖苷头聚合物的 GDN 变体。麦芽糖头束通过两个与主环/第二环（A/B 环）熟悉的羟基束直接连接到亲脂性聚集体。17 GDN-1 和 GDN-2 有两个麦芽糖苷束附加到两个相邻的碳（C2 和 C3）上。 ）的亲脂性聚集体（即薯蓣皂苷元）（方案1）。由于 GDN-3，这些头束被带入亲脂性聚集体的两个不相邻的碳（C3 和 C6）中。以这种方式，GDN-1/2 的头束周围与薯蓣皂苷元亲脂性聚集体分离，并且沿着这些路线具有深刻的两亲性，而 GDN-3 的两亲性水平通常较低，因为亲水性和亲脂性聚集体之间的隔离度降低（参见方案 1 中的纽曼预测）。GDN-1和GDN-2在两种麦芽糖苷聚集的相对方向上彼此不同；GDN-1 的麦芽糖苷聚集在环的另一侧（枢轴中心），而 GDN-2 的麦芽糖苷聚集在环的同一侧（热带中心）。GDN 的两个麦芽糖苷集合的相对区域和方向在方案 1 中的单独纽曼预测中示意性地说明。这些 GDN 与最近创建的 GDN 共享地薯皂苷元亲脂性单元和两个麦芽糖苷束，但与过去的专家不同之处在于它们包含直接的头尾关联，无需添加短的延伸连接子。

结论

根据两个麦芽糖苷头聚集体（顺式或反式）、亲脂性聚集结构（胆甾醇、胆固醇、谷甾醇或薯蓣皂苷元）的不同相对方式以及通过间隔物使用的清洁剂适应性，含类固醇清洁剂（GDN）的三种排列、SPS 和 SPS-L）作为层蛋白溶解和调整的混合装置进行了规划、布置和评估。总而言之，在新专家的这些安排中，SPS-L 展示了膜蛋白调整的最佳实践。一些 SPS-L，例如用于 LeuT 和β 2AR 的 SPS-1L，或用于 MelBSt 的 SPS-2L/3L，在保持蛋白质健全性方​​面比 DDM 更好。总的来说，这些 SPS-L 的执行（ β的 SPS-1L）MelBSt 的 2AR 和 SPS-2L/3L）甚至比第一个 GDN 更好。此外，这些新专家比 GDN 更容易使用，因为它们可以利用更少的工程惯例和更高的产量来做好准备。这连同它们对层蛋白调节的充分性，意味着这些 SPS-L 具有作为生化检查设备的明显潜力。此外，这里推荐的烷基间隔基在清洁剂活性中对蛋白质调整的作用应该给出有助于未来清洁剂计划和改进的清洁剂结构-充分性关系。