蛋白质组学与生物信息学杂志
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凸包集成分类器中蛋白质组图谱的新用途可预测妇科癌症患者对放疗副作用胃肠粘膜炎的易感性

拉尔夫·L·科德尔、兰迪·S·豪恩、埃里克·R·西格尔、张川雷、安吉拉·B·特拉梅尔、马丁·豪尔-詹森和亚历山大·F·伯内特

背景：全骨盆放射治疗是宫颈癌和子宫内膜癌术后治疗的常见做法。胃肠粘膜炎是放射治疗的不良副作用，是患者管理中的主要关注点。我们研究从计划接受妇科癌症放射治疗的患者的血液样本中获得的蛋白质组信息是否可以用于预测哪些患者最容易患放射诱发的胃肠道粘膜炎，以提高放射治疗的个体化。方法：我们使用基于凸包的选择性投票集成分类器对 17 名妇科癌症患者测量的 132 种蛋白质进行分类，将每位患者分为两类之一：不会（1 类）或（2 类）发生胃肠道粘膜炎的患者。我们采用 20 次重复的 10 倍交叉验证来测量分类准确性。结果：我们使用放射前蛋白质组学图谱预测哪些患者会经历胃肠道粘膜炎，平均预测精度达到 95% 置信区间 (0.711, 0.771)。对 12 种最重要的蛋白质的通路分析表明，它们可以组装成具有直接关联的单一相互作用网络。这 12 种蛋白质中数量最多的相关功能是细胞间信号传导和相互作用。结论：放射前蛋白质组学谱有可能对宫颈癌/子宫内膜癌患者在放射治疗后对胃肠道粘膜炎的易感性进行高精度分类。