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抽象的

泛癌症分析确定 SEC11A 是一种免疫学和预后生物标志物

吴庆庆、刘成东、黄光兆、卢欣艳、吕晓志、邵廷儒

目的：有限的证据表明SEC11A在致癌过程中起着至关重要的作用。本研究基于多组学数据对SEC11A在泛癌症中的分子特征和临床相关性进行了综合分析。

材料和方法：利用癌症基因组图谱-基因型-组织表达 (TCGA-GTEx) 项目的转录组谱和临床蛋白质组肿瘤分析联盟 (CPTAC) 项目的蛋白质组数据，分析了 33 种肿瘤和正常标本中的 SEC11A 表达。使用 cBioPortal 研究了全癌症中 SEC11A 的拷贝数变异和甲基化。在癌症基因组图谱 (TCGA) 队列中评估了 SEC11A 的临床相关性和预后意义。使用 Cluster Profiler 包对头颈部鳞状细胞癌 (HNSCC) 中的 SEC11A 进行了基因集富集分析 (GSEA)。使用免疫和癌细胞比例估计 (EPIC)、肿瘤免疫估计资源 (TIMER)、xCELL、微环境细胞群计数器 (MCP-counter)、quanTIseq、通过估计 RNA 转录本相对子集进行细胞类型识别 (CIBERSORT) 和免疫细胞丰度标识符 (ImmuCellAI) 算法估计 SEC11A 与免疫细胞浸润的相关性。抗癌剂的抑制浓度 (IC ₅₀ ) 值来自癌症药物敏感性基因组学 (GDSC) 项目，并计算了它们与 SEC11A 的相关性。

结果： SEC11A在大多数癌症类型（24/33）中表达上调，在3种癌症中表达下调。SEC11A基因扩增广泛存在于所有癌症中。SEC11A核糖核酸（RNA）表达与甲基化水平呈负相关。SEC11A上调提示肾上腺皮质癌和HNSCC预后不良。此外，SEC11A与细胞周期、TP53调控和抗原加工密切相关。SEC11A与肿瘤相关巨噬细胞和成纤维细胞呈正相关，与CD8 ⁺ T细胞呈负相关。SEC11A的表达与抗癌药物耐药性呈正相关。

结论：这些发现表明，SEC11A 可作为全癌症的预后生物标志物。SEC11A 的上调与肿瘤免疫抑制状态有关。总之，我们的研究结果提供了宝贵的资源，可能指导对癌症中 SEC11A 的机制和治疗分析。