临床和细胞免疫学杂志
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抽象的

多能因子 PBX1 预测类风湿关节炎的治疗效果

Karin ME Andersson1 、 Eric Malmhäll-Bah1 、 Nina Y.Oparina1 、 Weiyang Tao1 、 Aridaman Pandit2 、 Malin C. Erlandsson1,3、 Venkataragavan Chandrasekaran1 、 Sofia T. Silfverswärd1 、 Rille Pullerits1,3,4、 Maria I. Bokarewa1,3*

目的：我们通过询问 PBX1（一种维持干细胞多能性的转录因子）是否可以预测抗风湿治疗反应来研究类风湿关节炎 (RA) 中 T 细胞重建背后的分子机制。

方法：通过 RNA 测序对 87 名低疾病活动性 RA 患者和 78 名高疾病活动性 RA 患者的CD4 ⁺ T 细胞进行全基因组转录组学分析。比较PBX1 ^hi和 PBX1 ^lo组的治疗结果。^{通过对 PBX1 hi} CD4 ⁺细胞中差异表达的基因进行聚类，鉴定了 PBX1 相关表型和生物过程。通过基于单细胞的分析鉴定了胸腺中的PBX1 ^hi簇。通过DNA基序、染色质免疫沉淀测序和开放染色质数据的综合分析来预测DEG中的PBX1转录靶点。

结果： PBX1 ^hi CD4 ⁺细胞具有多能性印记特征并且缺乏细胞因子产生。在活动性 RA 中，PBX1 ^hi细胞富含 CD34 ⁺前胸腺淋巴细胞祖细胞。^{与 PBX1 lo}相比， PBX1 ^hi患者在抗 TNF 治疗中 DAS28 的降低更好，且无反应者的频率较低（两者均 p=0.026）。在非活动性 RA 中，PBX1 ^hi细胞富含表达 CD62L/SELL 和 CD31/PECAM1 的胸腺后幼稚 T 细胞。在这里，与 PBX1 lo 患者相比，PBX1 hi 患者需要更少的治疗来达到缓解^（p = 0.011）。在胸腺中，CD34 和 PECAM1 在 PBX1 内注释^嗨集群。综合分析表明，中枢 T 细胞成熟基因 TBX21、PRDM1、BATF3 和 KLF1 在转录上依赖于 PBX1。

结论：本研究表明 PBX1 的富集与 CD4 ⁺细胞的多能表型相关，这有利于 RA 的治疗反应。