蛋白质组学与生物信息学杂志

蛋白质组学与生物信息学杂志
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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

使用Logistic回归和结构信息预测不连续B细胞表位

刘蓉、胡建军

不连续B细胞表位的计算预测仍然具有挑战性,但它是疫苗设计中的一项重要任务。在本研究中,我们开发了一种新颖的计算方法,通过将逻辑回归模型与两个重要任务的特征结构(B因子和相对可及突变(RASA))相结合来预测不连续表位残基。我们分别对由与预告结合的前缀结构组成的目标数据集进行了五倍交叉验证,并分别在Epitome数据库上进行了独立测试。实验结果表明,除了华丽的RASA特征外,B因子还可以用于识别不连续表位。另外,这两个特征是互补的,它们的组合可以显着提高预测性能。

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