免疫组学研究
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PREDTAP：预测肽与抗原加工相关的人类转运蛋白结合的系统

张广兰、尼古拉·彼得罗夫斯基、Chee Keong Kwoh、J Thomas August 和 Vladimir Brusic

背景：与抗原加工（TAP）相关的转运蛋白是主要组织相容性复合体（MHC）I类抗原加工和呈递途径的关键组成部分。TAP 将抗原肽转运至内质网，并将其加载至 MHC I 类分子的结合槽中。由于肽必须首先由 TAP 转运才能呈现在 I 类 MHC 上，因此 TAP 结合偏好会对 T 细胞表位选择产生显着影响。描述：PREDTAP 是一个预测肽与人类 TAP 结合的计算系统。它使用人工神经网络和隐马尔可夫模型作为预测引擎。进行了广泛的测试以验证预测模型。结果表明，PREDTAP既敏感又特异，具有良好的预测能力（受试者工作特征曲线下面积Aroc>0.85）。结论：PREDTAP 可以与 MHC I 类结合肽的预测系统集成，以提高 T 细胞表位的计算机预测性能。PREDTAP 可供公众使用 [1]。