蛋白质组学与生物信息学杂志
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使用计算方法初步研究疟原虫与宿主蛋白之间的结合相互作用

诺伯特·恩万科沃 (Norbert Nwankwo) 和侯赛因·塞克尔 (Huseyin Seker)

后基因组科学家留下了大量的基因组和蛋白质组信息，例如肽和蛋白质残基，用于分析。例如，一种名为恶性疟原虫的疟原虫已被认为具有超过 4,600 种肽，这些肽可组装成超过 700 种蛋白质，并且人类基因组被确定拥有多达 20,000-25,000 个蛋白质编码基因。这些因突变而获得的蛋白质和肽需要不断重新评估，以设计治疗干预措施和改善我们的福祉。评估这些海量数据的临床方法非常昂贵、耗费资源和时间、费力且艰巨。因此，计算方法变得必要，因为它们将简化，重新制定战略并合理化用于寻找药物和疫苗的初步临床评估程序。在这项研究中，对 Plasmodial 及其宿主靶蛋白进行了研究，以查明已确定的临床发现与我们的计算结果之间是否存在相关性。这项研究披露，一些计算获得的结果与临床发现相关。例如，经临床验证可相互作用的环子孢子 (CSP) 和 Importin α 3 的粘附域在计算上具有相同的共识频率。另一方面，一些初步发现与我们的结果并不相关。这可能是蛋白质参与的结果。