蛋白质组学与生物信息学杂志
开放获取

抽象的

Prelocabc：使用贝叶斯分类器的蛋白质亚细胞定位的新型预测器

张艳琼、李涛、杨春元、李栋、崔宇、蒋颖、张凌强、朱云平、何福初

蛋白质的亚细胞定位对于细胞的动态生命至关重要。它的确定是阐明蛋白质生物学功能的重要一步。为此目的已经开发了各种实验和计算方法。使用贝叶斯模型，我们根据不同的蛋白质特征（如同源性、氨基酸组成、分选信号和功能基序）集成了五个子模块，以预测非植物真核蛋白质的亚细胞定位。该方法比之前针对五个独立测试数据集的算法具有更高的准确性和马修相关系数值，并且能够有效预测单定位和多定位蛋白质的九个主要亚细胞区室。作为一个应用程序，我们还将该方法与蛋白质组质谱定量信息相结合，显着提高了 PreLocABC 的性能。该方法已被开发成在线预测系统（PreLocABC）。用户可以在线提交自己的蛋白质序列，然后返回蛋白质亚细胞定位的预测结果。PreLocABC 的 Web 界面位于 http://61.50.138.123/PreLocABC。