蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

冷诱导基因 Dreb1A 的引物设计

内哈·加尔格、萨钦·庞迪尔、阿尼尔·普拉卡什和阿尼尔·库马尔

利用Primer3软件对冷诱导基因DREB1A进行引物设计。使用 Entrez 从 UniGene、GenBank 和 RefSeq 数据库中检索到 17 个与 DREB1A 基因相关的序列。通过多重序列比对，鉴定出 286 bp 的保守区域。使用Primer3 确定了保守区域和十七个核苷酸序列的潜在引物。使用 Premier Biosoft 的 NetPrimer 工具分析这些潜在引物的特性。最终确定了一种正向（5'端）和一种反向（3'端）引物，其GC含量为50%至60%，Tm为52至58℃，并且不存在二级结构。通过 BLAST 与 NCBI 的 nr 数据库进行局部比对来验证引物的特异性。所有比对均显示与 DREB1A 基因的显着比对，验证了引物的特异性。