蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

通过分子对接探测植物真菌蛋白的杀真菌活性

Pooja Mishra、Murugesh Eswaran、Nitya Meenakshi Raman 和 Tanushri Kaul

背景:植物真菌病害是叶子和作物损失的主要原因,最终影响整体经济成果和产量质量。因此,在农业中使用各种化合物来消灭真菌。

方法:虚拟筛选和分子对接策略为寻找先导化合物提供了很好的选择。将每种真菌感染的先导化合物与目标蛋白质序列对接,并评估最强的相互作用。

发现:研究中采用了各种分子,作为在植物病原体系统中引起杀菌反应的目标配体。彻底完成分子筛选以产生结果。通过这项研究确定的配体使我们能够使植物宿主对抗真菌病原体并预防疾病的发生。已经使用 SPDBV 和 PyMol 等各种软件以及 STRING、GenePept、PDB、UniProt、PatchDock、蛋白质结构预测服务器 -2 等各种在线数据库对相互作用进行了深入研究,以对设计的药物分子进行总体评估并研究其总体效果更高,并预防真菌病害的发生以及农业中针对各种经济价值植物的真菌病原体的管理。

应用:已针对目标病原体和宿主系统组件测试了杀菌化合物的分子亲和力,以了解相互作用并得出功能和分析。研究了分子和蛋白质之间的相容性,以破译分子的有效性及其在系统中的作用。目前的结果让我们建立了可用于开发抗真菌药物的先导化合物,尽管必须进行结构活性关系研究。

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