蛋白质组学与生物信息学杂志
开放获取

抽象的

根据稳态氧化水平，蛋白质半胱氨酸映射到功能网络

Young-Mi Go、Duc M. Duong、Junmin Peng 和 Dean P. Jones

半胱氨酸 (Cys) 蛋白质组在蛋白质结构、功能和调节中发挥着关键作用，并包括疾病氧化机制中的关键靶点。硫氧还蛋白以硫醇形式维持Cys残基，先前的研究表明，硫氧还蛋白在线粒体和细胞核中的氧化还原电位比细胞质中降低得更多，这表明这些区室中的蛋白质可能具有不同的稳态氧化。本研究通过质谱法测量了 HT29 细胞中 333 个蛋白质的 641 个肽基 Cys 残基的氧化分数。细胞质、核和线粒体蛋白的平均氧化相似（分别为 15.8%、15.5%、14%）。通路分析表明，与细胞骨架相关的蛋白质中细胞质 Cys 减少较多，Ran 信号传导和 RNA 转录后修饰导致核 Cys 减少较多，线粒体Cys的减少更与能量代谢、细胞生长和细胞增殖有关。更多氧化的细胞质 Cys 包括与 PI3/Akt、Myc 介导的细胞凋亡和 14-3-3 介导的信号传导的关联。氧化核和线粒体 Cys 分别与颗粒酶 B 信号传导和中间代谢的关联较弱。因此，稳态肽基Cys氧化与功能途径相关，而不仅仅是与细胞器分布相关。这表明疾病的氧化机制可能针对功能途径或网络，而不是单个蛋白质或亚细胞区室。氧化核和线粒体 Cys 分别与颗粒酶 B 信号传导和中间代谢的关联较弱。因此，稳态肽基Cys氧化与功能途径相关，而不仅仅是与细胞器分布相关。这表明疾病的氧化机制可能针对功能途径或网络，而不是单个蛋白质或亚细胞区室。氧化核和线粒体 Cys 分别与颗粒酶 B 信号传导和中间代谢的关联较弱。因此，稳态肽基Cys氧化与功能途径相关，而不仅仅是与细胞器分布相关。这表明疾病的氧化机制可能针对功能途径或网络，而不是单个蛋白质或亚细胞区室。