免疫组学研究

免疫组学研究
开放获取

国际标准期刊号: 1745-7580

抽象的

致病性沙粒病毒蛋白质序列数据库

Huynh-Hoa Bui、Jason Botten、Nicolas Fusseder、Valerie Pasquetto、Bianca Mothe、Michael J Buchmeier 和 Alessandro Sette

背景:沙粒病毒是啮齿动物传播的病毒家族,可引起多种出血热。这些疾病可能是毁灭性的,而且往往是致命的。在此,为了帮助设计和开发沙粒病毒感染的诊断、治疗和疫苗,我们开发了一个包含七种致病性沙粒病毒(胡宁、瓜纳里托、萨比亚、马丘波、白水阿罗约、拉沙和 LCMV)蛋白质序列的数据库。结果:数据库目前包含一组非冗余的 333 个蛋白质序列,这些序列均经过手动注释。所有条目均链接到 NCBI 并引用了 PubMed 参考文献。该数据库具有方便的查询界面,包括BLAST搜索。还进行了序列变异性分析,结果保存在数据库中。结论:该数据库可在 http://epitope.liai.org 上找到:

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