蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

通过可解离抗体微阵列 (DAMA) 染色技术对前列腺细胞进行蛋白质亚细胞定位分析

傅冠元、X 宋辛西娅、杨旭芬、莫一、G Wayne Zhou

背景:可解离抗体微阵列(DAMA)染色技术是一种对固定细胞中蛋白质表达和亚细胞定位谱进行全局分析的新方法。我们开发了这项技术并展示了其在识别乳腺癌细胞中差异表达蛋白质方面的应用。我们确定了乳腺细胞中 360 种蛋白质的亚细胞定位概况,并通过组合来自四个 96 抗体格式阵列的数据,鉴定了乳腺癌细胞中具有独特亚细胞定位的蛋白质。在本报告中,我们进一步开发了从单芯片以 400 种抗体形式同时确定 400 种蛋白质的亚细胞定位谱的技术。

方法:我们确定了 400 种阵列抗体在两种正常前列腺细胞系(PWR-1E 和 PZ-HPV-7)和三种癌细胞系(Du145、LNCap 和 VCap)中的亚细胞定位谱。通过图像数据库管理和分析程序 Chipview 比较和分析亚细胞定位概况。

结果:GRK2 蛋白被鉴定在一些癌细胞中具有独特的定位:定位于两种癌细胞系的膜中,以及定位于正常细胞系和一种癌细胞系的细胞质中。通过个体免疫染色证实了所识别的亚细胞定位差异。

结论:DAMA 染色技术可能是高通量格式的全局亚细胞定位分析的有效方法。

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