蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

专业草酸盐降解剂产酸草酸杆菌的蛋白质组动力学

梅丽莎·L·埃利斯、詹姆斯·莫布里、罗斯·P·霍姆斯和约翰·奈特

产草酸杆菌是一种独特的肠道生物，它依靠草酸盐降解来满足其大部分能量和碳需求。缺乏定植是草酸钙肾结石病的危险因素。基因组的释放O. formigenes 的序列为增加我们对 O. formigenes 生物学的了解提供了机会。本研究使用基于质谱的鸟枪蛋白质组学来检查与生长从对数期到稳定期过渡相关的蛋白质水平的变化。在 O. formigenes 菌株 OxCC13 基因组中的 1867 个独特蛋白质编码基因中，检测到了 1822 个蛋白质，这位于自由生活细菌中发现的 1500-7500 个蛋白质范围的较低端。从这里提供的蛋白质数据集可以清楚地看出，O. formigenes 包含肠道微生物预期的一系列代谢途径，使其能够生存并适应新环境。尽管需要进一步的实验测试来确认介导营养变化适应的生理和调节过程，但 O.不同条件下的蛋白质组动力学，具有发展假设的巨大潜力。