蛋白质组学与生物信息学杂志
开放获取

抽象的

尤文肉瘤蛋白质组表达数据库：日本蛋白质组学基因组医学数据库的一部分

菊田和隆、常广由香子、吉田明彦、栃木直文、广八节雄、河合晃、近藤正

尤文肉瘤是全世界儿童和青少年中第二常见的原发性恶性骨肿瘤。在这里，我们使用二维差异凝胶电泳（2D-DIGE）和质谱获得的蛋白质组数据报告了八个尤文肉瘤病例的开放获取蛋白质组表达数据库。从原发性肿瘤组织中提取的蛋白质用 CyDye DIGE Fluor 饱和染料标记，并使用大幅面电泳装置进行分离，产生 2431 个蛋白质点。凝胶内消化后的质谱鉴定出 330 个蛋白质点，对应 220 种蛋白质。从单个蛋白质点观察到多个蛋白质，并且单个蛋白质产生多个蛋白质点，表明 2D-DIGE 观察到的蛋白质组具有多样性。2D-DIGE和质谱蛋白质鉴定结果，部分相应的临床病理数据如治疗后的预后等可在公共蛋白质组数据库日本蛋白质组学基因组医学数据库（GeMDBJ Proteomics，https://gemdbj.nibio.go.jp/dgdb/DigeTop.do）中免费获取）。