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国际标准期刊号: 2090-4924
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波尔施A
对人体液体的蛋白质组研究已经成为揭示人类疾病的生物标志物最令人鼓舞的方法之一，对侮辱和慷慨的例子之间的对比进行研究可以提供有关疾病的重要数据。本研究的目标是识别、测量和分组存在于诽谤性上皮性卵巢肿瘤液体 (n=10) 和有利上皮性卵巢肿瘤液体 (n=10) 池中的蛋白质。将池暴露于蛋清和 IgG 的免疫耗竭、用丙烯酰胺命名同位素、通过 SDS-PAGE 分离以及用胰蛋白酶原位同化。所有胰蛋白酶肽均通过流体色谱颗粒交换分离，然后通过与质谱仪 LTQ-ORBITRAP (LC-MS/MS) 耦合的转台进行分离。我们在两个池中识别出 386 种基本蛋白质，谴责库中独特发现了 505 个蛋白质，友善库中独特发现了 272 个蛋白质。在显着的蛋白质（大约 1100 个）中，有 366 个表明依赖于同位素标记的相对评估。已知与恶性肿瘤相关的蛋白质在池之间被识别为差异收集的，包括粘蛋白 (CA125)、LCN2 (Lipocalin-2)、WFDC2 (HE4) 等。此外，所鉴定的蛋白质在文章中被称为生物标志物或广泛检查的卵巢疾病蛋白质的竞争者，如SPP1（骨桥蛋白）、MSLN（间皮素）、TTR（甲状腺素运载蛋白）、APOA1（载脂蛋白AI）和IGFBP2（胰岛素样发育）限制蛋白的因素2)。沿着这些思路，
卵巢恶性肿瘤是女性最严重、最致命的上皮疾病之一。上皮性卵巢恶性肿瘤有四种重要的组织学类型：浆液性、子宫内膜样、透明细胞和粘液性，它们的临床表现和原子性质都不同。浆液性亚型是最常被分析的，并且是大多数卵巢疾病的原因。目前还没有针对卵巢恶性生长的精确、非侵入性分析测试。大多数患者在进展阶段进行分析，发现转移、侵入腹膜孔和腹水。通过这种方式，在卵巢恶性肿瘤中大量且超然地传达蛋白质的可识别证据代表了一项重要的努力，并可能为卵巢疾病的临近提供早期见解，
从细胞表面分离的蛋白质和在任何情况下都排入细胞外区室的蛋白质的集合的可识别证据可以增加我们对肿瘤行为的理解，增加可感知的可使用的潜在示范标记物的识别和可能的标记物的识别。成像和有用的焦点仍然显示在细胞表面上。在卵巢恶性肿瘤的转移过程中，肿瘤细胞产生框架破坏蛋白酶，通过键颗粒脱落系统增加了细胞关联的中断。这些系统已在 ALCAM 和上皮钙粘蛋白 (CDH1) 的卵巢疾病中得到展示。
从内到外，定量蛋白质组学允许在肿瘤细胞和亚细胞区室中表达蛋白质的轮廓。一些蛋白质组学研究已经分解了卵巢恶性生长患者的卵巢肿瘤组织、细胞系、腹水和血液。无论如何，仍然需要系统地描述和分析一组蛋白质，这些蛋白质的区域使其与测定和治疗特别相关，特别是手机表面的蛋白质或释放到细胞外环境的蛋白质，并确定系统和蛋白质元素排放到细胞外空间。
我们描绘了三种卵巢腺癌细胞系 OVCAR3、CaOV3 和 ES2，就像从腹水中增强的卵巢恶性肿瘤细胞一样，通过对整个细胞裂解物、细胞表面蛋白质组和排出到细胞外区室的蛋白质进行自上而下的蛋白质组学研究。对这些信息的逐项调查发现了一些有趣的自然奇迹，包括在细胞表面交流的蛋白质的细胞外空间的广泛脱落以及蛋白质子集的高排放速度。该信息还包含已知与卵巢疾病相关的各种蛋白质标记。随后的开放数据集是揭示指示性和有用目标的资产，也是有关手机内部、手机表面和细胞外空间之间蛋白质循环的丰富数据源泉。
OVCAR3、CaOV3 和 ES2 细胞在含有 0.1% 透析胎牛样血清 (FBS) (Invitrogen) 和 13C-赖氨酸而非正常赖氨酸的 DMEM 培养基 (Invitrogen) 中培养，共 7 个条目（1