蛋白质组学与生物信息学杂志
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上皮样肉瘤的蛋白质组学特征

向原健太、久保田大辅、吉田明彦、浅野直文、末原佳之、金子和夫、河合晃、近藤正

上皮样肉瘤（ES）是一种罕见的软组织肉瘤，影响年轻人。它是一种生长缓慢的肿瘤，复发率高且转移至淋巴结。尽管在 ES 中发现了抑癌基因 SMARCB1/INI1 的缺失，但其分子背景因素在很大程度上尚不清楚。为了阐明导致 ES 恶性特征的分子畸变，我们研究了 ES 肿瘤组织中存在的蛋白质。匀浆组织样本的二维差异凝胶电泳显示 3363 个蛋白点，其中 91 个在 8 个 ES 病例中显示肿瘤和邻近非肿瘤组织之间的强度差异。使用质谱分析法，我们表征了与这些蛋白质点相对应的 69 种独特蛋白质。我们发现ES复杂的组织学是ES分子背景研究的障碍。例如，虽然通过蛋白质印迹证实了CAPZB在肿瘤组织中的较高表达，但免疫组织化学并没有确定CAPZB在肿瘤细胞中的特异性定位。我们的研究证明了蛋白质组学研究的可能用途，同时也证明了使用均质组织样本进行蛋白质组学的困难。