蛋白质组学与生物信息学杂志

蛋白质组学与生物信息学杂志
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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

基于蛋白质组学的朊病毒病生物标志物开发

Bo-Yeong Choi、Yeong Seon Lee、Young Ran Ju、Chi-Kyeong Kim 和 Su Yeon Kim

我们分析了 ME7 痒病感染小鼠大脑的蛋白质组谱,以及所选差异表达蛋白质的相互作用和功能,以鉴定可用于诊断朊病毒疾病的潜在新生物标志物。小鼠脑内接种感染 ME7 瘙痒病的小鼠大脑的 10% 匀浆,并监测神经症状。我们使用一维凝胶电泳和液相色谱-质谱法筛选了受感染脑样本中特异性表达的蛋白质。根据肽评分和比率值选择了 317 种蛋白质。确定的主要生物过程是细胞和代谢过程、定位和运输。选定的蛋白质具有与神经系统过程相关的功能,包括细胞间信号传导、神经冲动的传递、和突触传递。我们使用实验和计算方法分析了受感染的宿主细胞,发现了许多显着的蛋白质表达变化。我们鉴定了 43 种具有高肽分数和比率值的候选蛋白质。其中,36 种潜在候选蛋白与上调生物过程相关,7 种与下调生物过程相关。我们使用免疫印迹证实了其中两种差异表达候选蛋白的存在。

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