蛋白质组学与生物信息学杂志
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基于蛋白质组学鉴定暴露于三氧化二砷的人角质形成细胞中差异丰富的蛋白质

Udensi K Udensi、Alan J Tackett、Stephanie Byrum、Nathan L Avaritt、Deepanwita Sengupta、Linley W Moreland、Paul B Tchounwou 和 Raphael D Isokpehi

简介：砷是一种广泛分布的环境毒物，可引起多组织病变。蛋白质组学测定可以识别不同组织类型中砷调节的生物过程。

方法：使用无标记 LC-MS/MS 质谱工作流程对暴露于砷的 HaCaT 人角质形成细胞系的蛋白质丰度变化进行定量。使用蛋白质印迹和 RT-PCR 验证选定的蛋白质组学结果。开发了一种功能注释分析策略，其中包括异构数据集的可视化分析集成，以阐明功能类别。整合的注释主要是组织定位、生物过程和基因家族。

结果：暴露于砷的角质形成细胞中173种蛋白质的丰度发生改变；其中 96 个蛋白质丰度增加，77 个蛋白质丰度减少。这些蛋白质还被分类为 69 个基因本体生物过程术语。转铁蛋白受体蛋白 (TFRC) 丰度的增加经过验证，并注释为参与缺氧反应。总共 33 种蛋白质（11 种丰度增加，22 种丰度减少）与 18 个代谢过程术语相关。谷氨酸-半胱氨酸连接酶催化亚基（GCLC）是唯一用术语硫氨基酸代谢过程注释的蛋白质，其丰度增加，而琥珀酸脱氢酶[泛醌]铁硫亚基线粒体前体（SDHB）（一种肿瘤抑制因子）的丰度增加了。丰度减少。

结论：使用涵盖组织定位、生物过程和蛋白质家族的三个主要功能注释对三氧化二砷反应的 173 个差异丰富蛋白质进行分组。对砷中毒中观察到的色素沉着过度病理的一个可能的解释是，砷暴露导致正常缺氧的人体皮肤中铁的吸收增加。映射到代谢过程项且丰度不同的蛋白质是评估砷扰动代谢途径的候选蛋白质。