国际标准期刊号: 2471-9552
肖小强* 邓方、黄少芬
前mRNA加工因子31(PRPF31)是RNA剪接的关键成分,也是色素性视网膜炎(RP)的致病基因。此前,我们发现PRPF31中的无义突变R354X在中国RP家族中诱导RP。为了研究该突变引起的RP发病机制的重要分子机制,我们使用HEK293T细胞生成了稳定表达R354X突变体、PRPF31野生型(WT)和相应空载体的细胞系,所得细胞系用于长非编码RNA测序(LncRNA测序)。LncRNA测序结果显示,与WT相比,R354X突变改变了编码和非编码转录本的表达和剪接。有趣的是,在 HEK293T 和 APRE-19 细胞中,炎症相关基因如 IFI6、OAS3 和 STAT3,WT PRPF31 过度表达导致其表达增强;然而,在R354X突变细胞中,这些基因的表达仍保持在基础水平。此外,在 HEK293T 中表达 R354X PRPF31 的细胞中发现 H2AFX 表达增加和生长能力减弱。与WT相比,R354X突变体在HEK293T中的二氢叶酸还原酶(DHFR)上表现出不同的剪接模型。在IP分析过程中,我们发现R354X突变体减少了其与ARPE-19细胞中CPSF1和SORBS1 mRNA的结合,并且在ARPE-19细胞中其与CTNNBL1的结合也受到干扰。另一方面,R354X突变体也提高了转录本通读的水平。总而言之,PRPF31 中的 R354X 突变影响细胞存活,改变基因的表达和剪接。