蛋白质组学与生物信息学杂志
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减少的 PARP1 作为肾移植排斥反应的血清生物标志物

梅拉·斯里瓦斯塔瓦、耶利扎韦塔·托罗相、奥弗·艾德曼、凯瑟琳·乔兹维克、哈维·B·波拉德和罗西恩·曼农

血清蛋白质组学平台能够在移植相关的临床子集中进行表达谱分析，为识别能够准确预测移植结果的非侵入性生物标志物提供了机会。在这项研究中，我们试图鉴定可以预测肾同种异体移植排斥/损伤的候选血清生物标志物，无论其病因和治疗异质性如何。使用从肾移植患者和健康对照中收集的血清样本，我们首先采用 Clontech-500 Ab 微阵列来分析急性排斥 (AR) 和慢性移植物损伤 (CGI) 与稳定移植功能 (SF) 和正常肾脏 (NK) 的关系。通过对合并样本上的重复阵列进行 GenePattern 分析，我们确定了与性别无关的生物标志物 PARP1、MAPK1、SRP54、DP1 和 p57（FDR ≈ 25%），其一致下调代表了两种排斥/损伤类型（AR-CGI）常见的有害特征。与 AR-CGI 患者相比，反相阵列在 SF 患者的个体样本中发现 PARP1 上调 2 倍，ROC 为 0.87，从而使血清 PARP1 作为早期预后的生物标志物。Ingenuity Pathways Analysis (IPA) 将 PARP1 与其他一些标记 (MAPK1) 连接起来，阐明了它们可能的相互作用以及与免疫反应和移植物抗宿主疾病信号传导的联系。受损移植组织中血清 PARP1 的下调代表了一种有前景的非侵入性标志物，可以预测肾移植失败，无论排斥/损伤原因或性别如何。因此，