蛋白质组学与生物信息学杂志
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筛选和鉴定 GW9662 和 T0070907 过氧化物酶体增殖物激活受体 γ 强效拮抗剂的结构类似物：计算机模拟药物设计方法

Pramodkumar P Gupta、Shrinkhla Singh、Pritam Kumar Panda、Danish Ibrahim Jasnaik、Santosh S Chhajed 和 Virupaksha A Bastikar

PPARG基因编码的过氧化物酶体增殖物激活受体γ也被称为人类II型核受体，在调节葡萄糖代谢、脂肪细胞分化和作为脂质传感器方面发挥重要作用。这与肥胖、糖尿病、动脉粥样硬化和癌症等多种疾病的病理学有关。寻找使用 PPAR γ 作为其抑制治疗靶点的药物：Insilico CADD 方法已广泛用于这方面，以了解内在分子方面及其与化学物质的相互作用。基于计算机的虚拟筛选有助于在大型数据集中识别最佳分子，以阐明通过结合相互作用对特定靶标的影响，并可用于进一步的实验。在目前的研究中，本研究选择了两种 PPAR γ/拮抗剂 GW9662 和 T0070907，因为它们可作为有效的治疗药物，最大限度地减少 PPAR γ 对慢性疾病的影响。从ZINC公共数据库中筛选出一组GW9662和T0070907的结构类似物。基于配体的筛选之后是 80% 相似性搜索、Lipinski 过滤器、基于药效团和基于毒性的筛选。基于结构的虚拟筛选遵循 iGemdock 的输出和最终分子对接，Autodock 解释了结合亲和力和药理学相互作用。GW9662、T0070907和筛选的结构类似物之间的结果显示，相对于具有相似药理相互作用的前一种，具有更好的结合亲和力