病毒学与真菌学
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抽象的

几种新出现的猪博卡病毒的序列比较和系统发育分析以及命名建议

翟少伦、李晓鹏、陈勤岭、陈胜男、魏文康、罗曼琳

第一个博卡病毒（牛细小病毒 1，BPV1）于 1961 年在腹泻的小牛身上发现。此后，一系列
博卡病毒在许多动物中出现，包括狗、人类、猪、大猩猩、加州海狮和
猫。这些病毒与消化道和呼吸道疾病有关。
过去四年来，养猪场报告了几种新出现的猪博卡病毒（PBoV）。然而，用于
描述这些病毒的命名法一直很混乱且不规则。本研究的目的是比较
这些新兴 PBoV 的序列，进行系统发育分析，并提出有关其命名的建议。
一些 PBoV 和其他博卡病毒的基因组序列是从 GenBank 数据库下载的。顺序
使用DNAStar软件获得参考博卡病毒之间的相似性、序列突变、缺失或插入以及序列重组，
并使用MEGA 5.1软件确定其遗传进化。根据
PBoV序列和基因组结构的差异，提出了PBoV的命名法，将其分为
4个不同的物种（从PBoV1到PBoV4）和多种不同的基因型。其中，PBoV1
和PBoV2均具有两种基因型，分别为PBoV1-a和PBoV1-b以及PBoV2-a和PBoV2-a和PBoV2-b。
PBoV3包括三种基因型，分别为PBoV3-a、PBoV3-b和PBoV3-c。此外，对于 PBoV4，还有
种内至少有八种基因型（PBoV4-a 至 PBoV4-h）。总之，PBoV 具有高度的遗传多样性。
本研究中使用了拟议的 PBoV 命名法，它可以帮助我们更好地理解和
标准化 PBoV 命名法。