真菌基因组学与生物学
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稻瘟病田间无毒基因AvrPiz-T的序列变异和识别特异性

陈曦、陈美莲、胡金南、张文静、钟振辉、贾玉林、Ludovic Allaux、Elisabeth Fournier、Didier Tharreau、王国良、王宗华、沉伟强、陆国栋、王宝华、Thomas K. Mitchell

稻瘟病菌（Magnaporthe oryzae）是一种稻瘟病菌，会导致全球水稻年产量大幅下降。目前，最有效的疾病控制方法是通过将抗性（R）基因引入优良品种来部署宿主抗性。每个R基因的功能依赖于对病原体无毒力（AVR）基因的特异性识别。然而，由于野外种群中 AVR 基因的突变，引入的抗性可以在几年内被打破。从一些案例研究可知，AVR 突变模式彼此不同。因此，对 AVR 基因序列多样性的了解是引入新的抗性来控制稻瘟病的基础背景。在这项研究中，我们重点研究了新发现的 AVR 基因 AvrPiz-t。我们通过 PCR 扩增了 AvrPiz-t 的开放阅读框 (ORF) 以及启动子区域，以检测从 38 个国家和地区收集的 711 个米霉分离株中该位点的大小变异。通过对扩增位点进行测序和Southern杂交，将ORF中具有多态性的菌株根据突变类型和位点进行分组。计算该基因的自然选择强度，并应用致病性测定来评估 AvrPiz-t ORF/启动子多态性与毒力之间的关联。总之，AvrPiz-t 基因座的序列在启动子和 ORF 区域均含有变异。该基因座正在经历相对较强的正选择。编码序列的多样性和启动子区域中转座元件的插入使 M.