蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

蛋白质-淀粉样蛋白与变色龙序列的序列与结构关系

Banach M、Kalinowska B、Konieczny L 和 Roterman I

相同序列翻译成不同二级折叠的多肽链片段的存在引起了与淀粉样蛋白生成相关的结构变异性的问题。在本文中，基于模糊油滴模型评估相同序列对共同疏水核心的结构贡献。该模型将蛋白质分子中观察到的疏水性密度分布与其理想化对应物进行比较，其中所有亲水性残基都暴露在表面上，而所有疏水性残基都被内化。这些片段的构象变异被认为与其作用有关：它们要么参与稳定核心的形成，要么参与介导蛋白质的生物功能。模糊油滴模型提供了关于变色龙序列在朊病毒中的作用的线索，朊病毒被视为导致淀粉样蛋白形成的构象变化的潜在位点。