蛋白质组学与生物信息学杂志
开放获取

抽象的

通过蛋白质组学数据共享共享学术癌症中心生物样本和蛋白质组学核心设施的数据

Peter McGarvey、Ratna R Thangudu、马俊峰、吴慈、Shabeeb Kannattikuni、Krysta M Chaldekas、Deborah L Berry、Alicia Francis、Deepak Singhal、Paul A Rudnick、Anand Basu、Subha Madhavan

数据共享对于开放科学至关重要，并且资助组织和期刊经常要求这样做。NCI 开发了蛋白质组学数据共享 (PDC)，作为癌症研究数据共享的一部分，该基础设施允许用户利用云的存储和计算资源共享、分析和存储结果。迄今为止，各种数据共享中提供的大部分数据都是由 NCI 资助的大型多机构研究项目提交的，该项目由来自多个科学学科的专家团队组成。在这里，我们描述我们的经验并总结推荐的最佳实践，以共享一组蛋白质组学和相关生物样本数据，并分析在学术医疗中心核心设施中使用肺腺癌患者样本进行的小规模蛋白质组学研究的结果。

可用性：PDC 提供数据、元数据、肽和蛋白质鉴定方案。（https://pdc.cancer.gov/pdc/study/PDC000231）。