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鼠疫耶尔森氏菌的莽草酸激酶：序列、结构和功能分析

尼利玛·阿罗拉、曼加莫里·拉克希米·纳拉苏和阿米特·库马尔·班纳吉

鼠疫耶尔森氏菌是鼠疫的病原体，被广泛认为是潜在的生物恐怖主义威胁。由于人类中缺乏同源物，莽草酸激酶 (SK) 被认为是多种细菌和原生动物寄生虫的极好药物靶点。充足的文献证据证实了该蛋白质作为良好靶标的适用性。因此，鼠疫耶尔森氏菌中莽草酸激酶代表了一个有吸引力的药物靶点。在本研究中，采用聚类方法来选择属于鼠疫耶尔森氏菌的莽草酸激酶序列的适当代表，以进行结构测定。KFB61218.1 (SK1)、EFA47400.1 (SK2) 和 WP_016255950 酶的三维模型。1 (SK3) 是使用比较分子建模方法生成的，其中使用单个特定模板以及多个密切相关的模板开发结构。使用各种结构验证工具评估使用比较模型开发的莽草酸激酶的结构的立体化学质量。结构评估工具的结果表明模型的质量相当好。