生物学与医学高级技术
开放获取

抽象的

胶质母细胞瘤干细胞系的单细胞 RNA 测序揭示染色体不稳定性导致细胞外基质组织紊乱

鲁特维·瓦哈

根据2016年世界卫生组织（WHO）新的中枢神经系统（CNS）癌症分类，多形性胶质母细胞瘤（GBM）是中枢神经系统最常见的恶性肿瘤。GBM包含广泛的遗传和表观遗传变化，导致大量的突变亚群，其中一些已被证明在独立的患者生存和治疗反应中发挥作用。尽管 GBM 治疗取得了进展，但随着疾病的进展，被诊断患有这些肿瘤的患者往往预后不佳，生活质量也较低。神经胶质瘤干细胞的单细胞 RNA 高通量测序处理数据取自 GEO-NCBI，并进行分析以找出单个神经胶质瘤神经干细胞 (GSC) 和正常神经干细胞 (NSC) 中潜在的表达差异。我们对从 NCBI 生物项目 (PRJNA546254) 获得的 134 个样本（其中包括 75 个 GSC 和 59 个 NSC）的转录谱进行了生物信息学分析。进行的探索性分析显示 GBM 肿瘤和正常干细胞之间存在显着的基因表达变异模式。随后，Deseq2差异基因表达分析鉴定出GSCs和NSCs之间的383个差异表达基因[padj. 值 <0.05，log2 倍数变化 (>=+/-1.5)]。这项研究揭示了诸如 Deseq2 差异基因表达分析鉴定出 GSC 和 NSC 之间的 383 个差异表达基因 [padj. 值 <0.05，log2 倍数变化 (>=+/-1.5)]。这项研究揭示了诸如 Deseq2 差异基因表达分析鉴定出 GSC 和 NSC 之间的 383 个差异表达基因 [padj. 值 <0.05，log2 倍数变化 (>=+/-1.5)]。这项研究揭示了诸如LOX、LOX1、COL6A2、COL8A1、COL3A1、LUM、TGFB1、LAMA2、POSTN、MFAP5、MFAP2、FBN2、FLRT2 和HTRA1是神经胶质瘤细胞外基质组织和细胞外结构组织途径紊乱过程的关键特征。总之，这里提出的结果揭示了对 GBM 进展的新见解以及与神经胶质瘤发生有关的新基因的鉴定，可以进一步研究这些基因以实现治疗目标。