蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

SiRNA Scanner - 基于模糊逻辑的小干扰 RNA 设计工具

Vijayakumar Saravanan 和 Piramanaygam Shanmughavel

短干扰RNA的发现已经证实了破坏基因表达的简便调控方法的发展。然而，这种方法越来越受欢迎，设计有效的 siRNA 的要求可能很高。因此，我们开发了 siRNA Scanner，这是一种 siRNA 选择程序，可以从给定的 RNA 序列中自动选择小干扰 RNA。siRNA Scanner 使用基于模糊逻辑的系统来计算 siRNA 质量。该程序完全采用 Practical Extract Report Language (PERL 5.8.8.6 Build 820) 构建，可通过命令行界面访问。siRNA Scanner 的高性能、最少的用户交互及其快速算法，使该程序对于选择小干扰 RNA 进行基因表达研究非常有用。