理论与计算科学杂志
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完成规范遗传密码的建议：蛋白质组密码和核酸辅助蛋白质折叠

简·查尔斯·比罗

背景：本研究旨在总结 2002 年至 2012 年间关于核酸和密码子的结构、密码子和核酸之间的相互作用以及翻译的一般概念的一系列生物信息学观察结果。方法：本研究期间利用了公共数据库和资源，以及测定各种密码子残基中自由折叠能的测定。结果：这项研究表明，分子生物学领域广泛持有的范式应该进行修改。特别是，它表明密码子的发展与编码的氨基酸相关，并且在同义密码子中摆动碱基不是随机选择的，因为它们在确定核酸结构及其折叠能方面具有明确的作用。此外，蛋白质组密码决定了共定位氨基酸优先由互补密码子编码（至少在第一个和第三个密码子位置），并且翻译过程中核酸和蛋白质之间的结构信息传递需要“专用”氨基酸和它们的直接接触。密码子。此外，这项研究强调了一个事实，即存在一个 tRNA 循环，使得密码子氨基酸直接接触成为可能。结论：这些观察结果提供了对冗余遗传密码和蛋白质折叠机制的更完整的理解。此外，蛋白质组代码为科学家设计对目标肽具有高亲和力和特异性的相互作用肽提供了第一个真正的可能性，