当前合成与系统生物学
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合成生物学：计算模型弥合体外和体内反应之间的差距

维尔玛·G·杜沙克

合成生物学首先是指设计和制造自然界中尚不存在的生物成分和系统，以及对现有生物系统的重新设计和制造。将计算工具与无细胞系统联系起来，转化为合成生物学，是通过分子生物学和工程方法相结合构建人工生物系统的新兴领域专家。在此，描述体内和体外反应和系统之间差异的大多数发现已被广泛描述。计算工具在被称为人工细胞的体外基因表达平台设计中的具体应用，它的组成部分以及为预测处理器模块的活动和控制基因表达而开发的策略已经被详细讨论。人工细胞在药物输送、生物合成等方面的潜在应用已经被描述。可能开发无细胞合成生物学计算工具箱的两个模型来源包括：i）能够根据原始原理创建单细胞成分的物理模型，指导重点关注预测特定成分的结构和动力学的工具；ii）用于预测自然细胞系统动力学的广泛数学模型。关于建模算法，合成生物学家可以使用多种模型，并且为有兴趣开发无细胞系统工具的研究人员确定了一些潜在增长领域。其中，确定性模型、探索性模型、分子动力学模型、随机模型、全原子模型等都得到了描述和讨论。通过使用计算模型建立体外反应和体内系统之间的定量差异，可以识别活生物体中的特定机制，以进一步用于体外反应，以促进其过程。因此，计算模型将弥合体外和体内反应之间的差距。通过使用计算模型建立体外反应和体内系统之间的定量差异，可以识别活体生物体中的特定机制，以进一步用于体外反应，以促进其过程。因此，计算模型将弥合体外和体内反应之间的差距。通过使用计算模型建立体外反应和体内系统之间的定量差异，可以识别活体生物体中的特定机制，以进一步用于体外反应，以促进其过程。因此，计算模型将弥合体外和体内反应之间的差距。