抗病毒与抗逆转录病毒杂志
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抽象的

水泡性口炎病毒糖蛋白作为抗病毒药物的靶标和丹酰尸胺的对接

阿皮塔·班纳吉和莎拉·S·切里安

弹状病毒包括水泡性口炎病毒（VSV）和著名的人类病原体，例如狂犬病病毒和金迪普拉病毒。靶受体建模和结合位点识别是开发新治疗剂的重要步骤。选择性结合膜融合途径蛋白质的配体可以延迟或阻止病毒进入。在这项研究中，VSV 的表面糖蛋白 G 被选为潜在的抗病毒靶点。丹磺酰尸胺、金刚乙胺和金刚烷胺是已知的抑制剂，已被证明可以防止 VSV 内化，但其抑制的分子机制尚不清楚。通过进行计算机模拟结合位点识别和对接研究，探索了这些配体作为融合抑制剂的潜力。预测 G 三聚体界面中存在配体结合袋。对接时，丹磺酰尸胺与蛋白质结构转变为融合活性形式所需的残基片段进行了有利的接触，而金刚乙胺和金刚烷胺未能对接到结合袋中。我们的结果表明，丹酰尸胺可以通过稳定 G 蛋白的预融合构象来防止病毒进入。这项研究的结果可以扩展到设计针对同一家族其他病毒的抗病毒药物。