蛋白质组学与生物信息学杂志
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家蚕血清素受体的理论建模与对接研究

Ramasamy Sumathy、SK Ashwath 和 VK Gopalakrishnan

蚕血清素受体蛋白是一种完整的膜蛋白，属于最大的 G 蛋白偶联受体超家族，通过与异三聚体 G 蛋白相互作用跨细胞膜传递信号，并调节许多生理过程，包括调节摄食、攻击性尽管血清素受体蛋白很重要，但由于结晶困难，其结构尚未通过实验确定。三维结构由 MODELLER 程序使用模板 rh1A 建模，其同一性为 33%。使用 Procheck 和 Ramachandran 图验证了建模结构。结果发现，位于最有利区域、额外允许区域、慷慨允许区域的残留物百分比，不允许的区域分别为 93.3%、6.4%、0% 和 0.3%，这表明模型相当不错。ERRAT 图的总体 Procheck G 因子和总体质量因子分别为 0.04 和 80.759。使用 Q-Sitefinder 预测血清素受体蛋白的结合位点，并与血清素激动剂进行相互作用研究，揭示血清素受体蛋白的七个相互作用残基 Asp141、Val142、Gln218、Thr227、Ser230、Phe382、Leu405 与血清素形成三个氢键。这项研究提供了对蚕血清素受体蛋白三维结构及其结合位点的原子水平的结构理解，并阐明了许多有前途的活性先导化合物。分别，它表明相当好的模型。ERRAT 图的总体 Procheck G 因子和总体质量因子分别为 0.04 和 80.759。使用 Q-Sitefinder 预测血清素受体蛋白的结合位点，并与血清素激动剂进行相互作用研究，揭示血清素受体蛋白的七个相互作用残基 Asp141、Val142、Gln218、Thr227、Ser230、Phe382、Leu405 与血清素形成三个氢键。这项研究提供了对蚕血清素受体蛋白三维结构及其结合位点的原子水平的结构理解，并阐明了许多有前途的活性先导化合物。分别，它表明相当好的模型。ERRAT 图的总体 Procheck G 因子和总体质量因子分别为 0.04 和 80.759。使用 Q-Sitefinder 预测血清素受体蛋白的结合位点，并与血清素激动剂进行相互作用研究，揭示血清素受体蛋白的七个相互作用残基 Asp141、Val142、Gln218、Thr227、Ser230、Phe382、Leu405 与血清素形成三个氢键。这项研究提供了对蚕血清素受体蛋白三维结构及其结合位点的原子水平的结构理解，并阐明了许多有前途的活性先导化合物。使用 Q-Sitefinder 预测血清素受体蛋白的结合位点，并与血清素激动剂进行相互作用研究，揭示血清素受体蛋白的七个相互作用残基 Asp141、Val142、Gln218、Thr227、Ser230、Phe382、Leu405 与血清素形成三个氢键。这项研究提供了对蚕血清素受体蛋白三维结构及其结合位点的原子水平的结构理解，并阐明了许多有前途的活性先导化合物。使用 Q-Sitefinder 预测血清素受体蛋白的结合位点，并与血清素激动剂进行相互作用研究，揭示血清素受体蛋白的七个相互作用残基 Asp141、Val142、Gln218、Thr227、Ser230、Phe382、Leu405 与血清素形成三个氢键。这项研究提供了对蚕血清素受体蛋白三维结构及其结合位点的原子水平的结构理解，并阐明了许多有前途的活性先导化合物。