蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

人体细胞、组织和器官中的组织特异性蛋白质表达

马库斯·格里、佩尔·奥克斯沃尔德、弗雷德里克·庞腾和马蒂亚斯·乌伦

了解人类生物学的一个重要部分是在基因和蛋白质水平上研究组织特异性表达。在本研究中,根据公共人类蛋白质图谱数据库(www. Proteinatlas.org)上提供的组织微阵列数据进行组织特异性蛋白质表达的分析。对 65 种人体组织和细胞类型中的人类蛋白质(相当于大约三分之一的蛋白质编码基因)进行了分析。使用分层聚类和主成分分析等无监督方法以及监督方法,对人体不同器官和组织的不同细胞群中 6,678 种人类蛋白质的空间分布和相对丰度进行了分析(Breiman,2001) 。知名标记诸如中枢神经系统的神经调节蛋白、胃肠道的角蛋白 20 和造血细胞的 CD45 等,被确定为组织特异性的。鉴定了所有研究组织中细胞以组织特异性方式表达的蛋白质,包括中枢神经系统、造血系统、鳞状上皮、间充质细胞和胃肠道细胞。一些尚未与组织特异性相关的蛋白质被鉴定出来,为进一步研究探索组织特异性功能提供了起点。这包括功能未知的蛋白质,例如中枢神经系统中表达的 ZNF509 和胃肠道中表达的 C1orf201。一般来说,

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