生物医学数据挖掘国际期刊

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国际标准期刊号: 2090-4924

抽象的

从 RNA 世界到人类大众社会的 T 模式和自相似性

马格努斯·马格努森

几千年前,作曲的创新以及随之而来的强大的外部T型记忆——一种自然的眼睛闪烁——使得社会记忆在很大程度上成为大脑的外部,并且主要的巨大的提升塑造大众社会秩序并推动科学和创新。多年前,这种关系和自我亲密感正随着 RNA 世界无穷无尽的 DNA 创造而受到冲击。

寻找跨不同关联程度的瞬态和空间设计的自我可比性显然需要至少两个级别的示例类型。各种层次的自我比较的 T 型设计以值得注意的解释均匀性重复,最初的特点是识别复杂的、适应性极强的、平等的间歇性连续例子,大部分是生物和人类的非语言行为和联系。无论如何,这种例子在那时也成为了较低水平的基础,即大脑内神经元系统的连接。从长远来看,在 DNA、RNA 和蛋白质的水平仍然较低的情况下,空间 T 型设计似乎是极其正常的(甚至是不可避免的)。话又说回来,通常用于描绘 DNA 结构的设计类型通常过于简单或不灵活,无法描绘和找到持续的人类合作设计。RNA世界包括记忆之外的DNA和控制串以及蛋白质大众社会秩序(细胞城市区域),随后发展为细胞大众社会秩序(身体)。终于,大众社会的身体秩序得到了发展,但仅限于虫子和人类。在令人毛骨悚然的爬行动物中存在了很多年,但在人类中却存在自然的斜视。在蛋白质和人类的大众社会秩序中很重要,但在所有其他秩序中却缺失了,超个体长T型设计的字符串(分别是DNA和文本)通常比单个居民的寿命长得多。这些使得几乎能够掌握基于DNA的生命,并促进了人口规模相当于最拥挤的蛋白质城市地区的人类大众社会秩序的进步,以及大众宗教和法律在人类大众社会秩序中的出现,就像当今的科学与创新;最终,除其他外,我们还致力于揭示蛋白质及其纳米级的大众社会秩序。似乎可以想象,对每一种大众社会秩序的研究都可能为下一种秩序提供新的知识和思想。

这项工作于 20 世纪 70 年代中期开始,其动机是社会联系检查,该检查依赖于直接感知和对实践的谨慎编码,如行为(通常是行为学)分类的概要所示,特别是 N. Tinbergen、K. Lorenz 和 K. von Frisch 共同获得 1973 年诺贝尔医学或生理学奖,此外 H. Montagner 对社会性令人毛骨悚然的爬行动物和儿童之间的关系进行了行为学检验。邓肯(S. Duncan)对人类联想轮流的精神和词源学检查给予了非凡的动力,从而完成了乔姆斯基在句法结构方面的工作和斯金纳正在进行的概率性有用研究及其由此产生的玩笑。T 型设计是一种关于各种瞬态和空间规则,特别是自然结构的推测,是一种渐进的自可比较分形结构,它在单独的离散测量上以临界平移均匀性重复,首先是连续的。它还关注自然时空关联的多个程度的显着自相似性,因为它对于原子结构来说似乎是正常的,例如,DNA 的质量和大量间歇性意图及其与(3D)相比的 3D 推测塌陷的蛋白质。T 示例及其识别计算最初是为了鼓励观察性研究而发展起来的,最初是通过利用高级计算的 THEME (3 k Fortran IV) 编程在人工智能 (Magnusson, 1981) 和应用统计学 (Magnusson, 1983) 中引入的。它目前有超过 30 万行代码,在 Windows 下运行,而且最近还使用同样的加速方法。这使得在不同尺度的各种有机奇迹中,从人类在天的时间尺度上的行为(Hirschenhauser et al., 2002; Hirschenhauser and Frigerio, 2005)到同时众多个体神经元的协作,这使得被遮蔽的结构得以大量定位。注册了啮齿动物大脑神经系统 10-6 秒的短暂目标,以推进处理空间纳米尺度 DNA 原子的 T 设计。因此,T 型设计定位和检查 (TPA) 融合了主观和定量研究,因为 T 型设计本身是由重复编码分类构成的虚假分类,其发生次数之间具有不常见的真实规模可测量关系。

介绍

在复杂的益生元框架的元素领域,一个可验证的重要理论限定是特征性和外在决定的自关联。达尔文选择是在艾根 (Eigen, 1971a) 的带头著作中作为原子遗传自我关联的世界观而建立的。与自然选择相比,复制聚合物变异的混合和降解速度不同,聚合物群体内部元素的边界特征,足以在群体占有中建立阶段性进展,与自然选择相比,因为有规律的决定,取决于其精确度。聚合物在特定边缘上重复。是因为它可能,核酸(RNA 和 DNA)是通过读取和复制成分结合的主要聚合物,它们通常不会合理地追求持久性,如它们不同的融合和腐败速度所表明的那样。或者,它们的耐力可能是由一个相当复杂的模仿单位(例如细胞)的健康状况控制的。如果核酸以某种方式增加或没有降低其所在细胞表型的健康度,则该核酸具有腐蚀性。在这些条件下,一般核酸腐蚀性聚合物内部的自缔合依赖于与聚合物复制过程本身无关的因素。令人眼花缭乱的选择无法细读表型特性并将其再次复制到遗传信息中。总的来说,当批评促使日益复杂的个体框架(Hogeweg和Takeuchi,2003)被远程强迫时,就会看到外在决定的自我关联,并且仅仅因为它们的内部结构恰好丰富了扩散单位而得到承认,这些单位是通常的例子(Szathmáry 和 Demeter,1987)在获胜的自然条件下(食物的可及性、寄生虫的不出现等)具有特定的回旋余地。运营变革的“选择水平”(Keller,1999;Okasha,2006)高于任何单个细分市场。坤等人。(2015) 详细描述了外在决定的自我关联在 RNA 世界情境中的根本作用。当批评促使日益复杂的个体框架(Hogeweg 和 Takeuchi,2003)被远程强迫时,就会看到外在决定的自我关联,并且承认仅仅是因为它们的内部结构恰好丰富了扩散单位,这通常是例证(Szathmáry 和 Demeter, 1987),在获胜的自然条件下(食物的可及性、寄生虫的不出现等)有一定的回旋余地。运营变革的“选择水平”(Keller,1999;Okasha,2006)高于任何单个细分市场。坤等人。(2015) 详细描述了外在决定的自我关联在 RNA 世界情境中的根本作用。当批评促使日益复杂的个体框架(Hogeweg 和 Takeuchi,2003)被远程强迫时,就会看到外在决定的自我关联,并且承认仅仅是因为它们的内部结构恰好丰富了扩散单位,这通常是例证(Szathmáry 和 Demeter, 1987),在获胜的自然条件下(食物的可及性、寄生虫的不出现等)有一定的回旋余地。运营变革的“选择水平”(Keller,1999;Okasha,2006)高于任何单个细分市场。坤等人。(2015) 详细描述了外在决定的自我关联在 RNA 世界情境中的根本作用。并被承认只是因为它们的内部结构恰好丰富了增殖单位,这通常被例证(Szathmáry和Demeter,1987)在获胜的自然条件(食物的可及性、寄生虫的不出现等)下具有特定的回旋余地。 。运营变革的“选择水平”(Keller,1999;Okasha,2006)高于任何单个细分市场。坤等人。(2015) 详细描述了外在决定的自我关联在 RNA 世界情境中的根本作用。并被承认只是因为它们的内部结构恰好丰富了增殖单位,这通常被例证(Szathmáry和Demeter,1987)在获胜的自然条件(食物的可及性、寄生虫的不出现等)下具有特定的回旋余地。 。运营变革的“选择水平”(Keller,1999;Okasha,2006)高于任何单个细分市场。坤等人。(2015) 详细描述了外在决定的自我关联在 RNA 世界情境中的根本作用。1999;Okasha,2006)高于任何单个细分市场。坤等人。(2015) 详细描述了外在决定的自我关联在 RNA 世界情境中的根本作用。1999;Okasha,2006)高于任何单个细分市场。坤等人。(2015) 详细描述了外在决定的自我关联在 RNA 世界情境中的根本作用。

有趣的是,特征决定的自我关联依赖于框架内部各部分之间的联系,其中包含批评,通过增强某些内部程序而损害其他程序,从而将框架推向更高的多方面性。通常,自我联想的特有驱动力源于框架内部元素的一些不稳定:某些循环过程被引入自我增强模式,直到框架到达另一个阶段,这种模式才会被完全抑制。独特的吸引子,通常是较高散射和较低熵的条件(Prigogine 和 Nicolis,1971)。一个人自己设定的状态本质上是稳定的,因为任何逐渐偏离它的状态都会短暂地产生一种重新建立它的比较动力。与基因型相反,原子表型固有地确定的自关联的世界观是在反射性数据的视野内编码的发展,即编码 aaRS 任务推动力的编码集的质量(Bedian 1982;Wills 1993)。伙伴论文(Carter 和 Wills,2017)通过展示其特征事件的安装方式扩展了我们对自反性的理解,其中氨基酸的物理科学驱动蛋白质折叠以提供用于氨基酸特定识别的辅助成分,如下所示它们的物理特性和 tRNA 依赖于比较连续主题的接近程度,首先是在受体茎中,后来是在反密码子圈中。

Model of translation dynamics

我们考虑一种改进的蛋白质融合模型,该模型以其数据传输观点为中心:将遗传分组中特定情况下的密码子解释为蛋白质连续中特定情况下的合适氨基酸。我们特别考虑解释任务本质上是概率性的,并且以这种方式与错误率相关。我们还强调,所有已知的氨酰-tRNA 合成酶(aaRS)催化剂本身都是由对遗传安排的错误解释而产生的蛋白质。为了简单起见,我们考虑一种非重复代码,其中每种氨基酸都有一个密码子。解释任务依赖于aaRS物种的速率,无论是蛋白质还是推测的核酶,在不可分割的概率设计中“准确”或“错误”地对 tRNA 进行充电。现代原子有机框架估计了一个真正的密码:aaRS化学物质将明确相关的氨基酸与带有与明确的比较密码子相关的反密码子的tRNA连接起来,并且存在异常不一致的错误。

为了保持可管理性,我们忽略了混乱——编码过多;开始和结束;可变的解释率;核糖体在不常见密码子处减慢或当带有完整反密码子的 tRNA 耗尽时;肽链延长和核糖体运动等的能量学——这会导致真正的亚原子有机框架的修饰。我们将考虑当遗传分组在可验证同步的一点一点过程中被解释时会发生什么,目标是蛋白质以相似的速度从相似长度的每个遗传排列中精心编排,并且核糖体作为机械精密棘轮小工具进行。这种“准确性核糖体”模型将保证我们发现的影响将完全取决于解释表的活性和可靠性,该解释表表征了进行密码子到氨基腐蚀任务的速率,无论它们是否被视为“正确”或“不正确”。如果事实证明编码的诞生地依赖于解释及其元素的明确亮点,例如,参与该过程的各个部分的总体大小,那么这种纠缠将意味着需要一起改进解纠缠模型它展示了重要的奇迹。

结束语

在可证明的亚原子科学中,遗传数据和编码的有用蛋白质的耦合宇宙的直接发展肯定比任何情况都更容易想象,在这种情况下,存在一个足够复杂的核酶的潜在RNA世界,可以发挥遗传密码的作用。从各方面来看,在原子科学的部落 aaRS 化合物的任何此类框架的真正重要进展期间,编码数据处理的保护似乎是不可想象的,从逻辑上讲,RNA 编码世界的想法是不必要的。虽然这一目标的基础是准确地理解亚原子科学的动态设计如何解决代码开发的计算鸡生蛋蛋生鸡的难题,但它留下了一大堆与令人困惑的解释机械组装的进展有关的问题。话又说回来,认识到反身性在驱动亚原子有机编码固有的自关联方面的作用,激发了对 aaRS 编码装置的基本决定因素之间联系的更深刻的探究(Carter 和 Wills,2017)。自反性数据对任务推动力进行编码(如任务执行代码的标准所示)的适当先决条件是基于渐进的基本物理自反性。在可证明的原子连接的动态过程中启动自反性的计算先决条件,要求它落在自然上,或者我们可以说“找到”,纳米级“规则”的自我强化安排,用于我们感知的例子的发展作为两种大分子聚合物序列之间的“编码连接”。尽管如此,大自然本质上对这种反映是粗心的:氨基酸与密码子的协调是通过折叠的 aaRS 结构来完成的,无论如何,根据量子力学的要求,这些结构是通过计算控制的氨基酸与各种物理结构的排列“巧合”创建的。两个必需蛋白质折叠的变异的明确位置的特性,称为“I类”和“II类”。事实上,即使是这种最不困难的区分也必须是其自身的启示,一个“启动块”,可以基于并解释为通过变异密码子-氨基腐蚀性配对的逐步解决而对一般遗传密码进行不切实际的精致安排。这种发展始终是由最近可辨别的折叠蛋白质的辅助成分决定的,这些成分可以更精确地分离氨基酸并比较 tRNA 分组主题,在每个点上肯定会启动“具有任何效果的区别”,贝特森(1972)被描述为通常实用数据的基本单位。尽管目前还无法说明自然取得的重要进展,但我们正在朝着 aaRS 系统发育学研究可以使我们更接近这一目标的方向前进。此外,我们现在可以看到如何“从底层”更接近自己整理的编码条件,而不是认为它几乎是由于错误的虚张声势而造成的灾难性的失败:解释精度的逐步提高将创建复制酶粒子,这些粒子更加忠实地从编码它们的质量中传递出来,很可能促进数据复制的稳定改进,从而适应较小的遗传准种的确定,稳定地更好地编码框架所依赖的蛋白质功能,包括精确的解释。作为一个自我增强的过程,无限循环可以从下面快速扭转,而不是从上面解开悬崖,推拉压力稳定地将框架保持在接近临界点的位置,在其他条件相同的情况下,启发复制和解释保持阻抗协调——也就是说,直到框架陷入另一个可想象结果的漩涡。

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