国际标准期刊号: 2161-0932
Samuel C Mok、Jae-Hoon Kim、Steven J Skates、John O Schorge、Daniel W Cramer、Karen H Lu、Choong-Chin Liew
目的:利用基于全血的基因表达谱来确定用于早期检测卵巢癌的候选基因组特征。
实验设计:我们对从 14 名卵巢癌患者和 15 名年龄匹配的健康女性获得的全血 RNA 样本进行了 Affymetrix U133Plus 2.0 GeneChip 微阵列分析。使用参数韦尔奇 t 检验鉴定差异表达的基因。使用 14 个基因特异的引物组,对从 96 名卵巢癌患者和 83 名年龄匹配的健康女性制备的 RNA 进行实时 qRT-PCR 分析。曼惠特尼 U 检验评估了个体基因的显着性。CA125 水平在同一组样品中测定。我们使用逻辑回归分析和交叉验证来评估特定转录本与 CA125 的线性组合区分癌症与对照的能力。
结果:微阵列分析显示,与卵巢癌患者相比,9583 个探针的健康女性血液基因表达谱存在显着差异(p<0.05)。对 96 个病例和 83 个对照的实时 RT-PCR 分析验证了 7 个基因,显示病例和对照的表达水平存在显着差异。Logistic 回归分析和交叉验证确定了一组最佳标志物,包括 CA125、BRCA1 和 KIAA0562,可以将单独使用 CA125 的敏感性提高到 90% 以上,检测早期卵巢癌的特异性为 98%。
结论:循环血基因表达谱鉴定出的RNA标记物可以提高CA125检测早期卵巢癌的敏感性。需要进一步验证以确认这些生物标志物的临床用途。