临床试验杂志

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国际标准期刊号: 2167-0870

抽象的

使用定量实时 PCR 验证越橘果实发育中基因表达分析的参考基因

何峰*、桂亮贤、张艳、朱波、张小平、沉敏、万凤英、杨路、肖佳欣*

背景:Vaccinium bracteatum Thunb。(VBT)广泛分布于我国东部和南部山区。VBT叶具有很大的药用价值,可用于染色米制“乌米饭”。其果实也含有丰富的营养成分。然而,人们对探索 VBT 分子含量的关注有限。此前,我们对处于不同成熟阶段的三种典型 VBT 水果进行了 RNA 测序,尽管在验证过程中丢失了可靠的参考基因。

结果:在本研究中,我们根据之前的研究和转录组学分析选择了十个候选内参基因。随后,使用geNorm、NormFinder、Bestkeeper等组合方法对这些基因进行评估,并进行综合排名评估。结果,我们发现actin2、NADH和ADK基因对于分析果实发育相关基因的表达水平具有很高的可靠性。此外,以NADH为内参基因评估了转录组分析中15个DEG的转录水平,RT-qPCR数据与转录组数据高度一致。

结论:本研究结果为进一步研究基因表达提供了可靠的内参基因,有利于全面探索VBT。

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