蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

世界上最辣的辣椒 Bhut Jolokia(Capsicum assamicum)蛋白质组揭晓:差异表达蛋白质的比较蛋白质组分析

Jubilee Purkayastha、Syed Imteyaz Alam、Nabonita Sengupta、Bikash Nath、Bhoj Kumar、Hemanta Kumar Gogoi、Lokendra Singh 和 Vijay Veer

通过蛋白质组分析(包括 2-DE、图像分析和 MALDI-TOF/MS 蛋白质鉴定),对来自水果的总提取物进行了一项研究,旨在增强对整个水果蛋白质组和差异表达蛋白质和/或基因产物的了解。 Bhut Jolokia(Capsicum assamicum)和不太刺鼻的 Capsicum frutescens。使用 2-DE/MS 技术总共鉴定了 107 个主要蛋白质点。在鉴定的蛋白质中,14个蛋白质表现出在Bhut Jolokia中独特表达的定性差异,6个蛋白质表现出定量差异表达变化。6种差异蛋白中,1种下调,5种上调。除了无法分配直系同源群 (COG) 簇的独特和差异蛋白外 (36.84%),大多数主要的独特和差异表达蛋白质被分配给能量产生和转换(21.05%)以及碳水化合物运输和代谢(21.05%)的COG。通过半定量 RT PCR 和定量实时 PCR 进一步证实了选定候选物的这种差异蛋白表达。这是世界上最辣的辣椒“Bhut Jolokia”的首次蛋白质组学描述,对这些蛋白质的详细功能分析将提供有关辣椒素这一重要来源的复杂细胞过程和辛辣机制的进一步信息。通过半定量 RT PCR 和定量实时 PCR 进一步证实了选定候选物的这种差异蛋白表达。这是世界上最辣的辣椒“Bhut Jolokia”的首次蛋白质组学描述,对这些蛋白质的详细功能分析将提供有关辣椒素这一重要来源的复杂细胞过程和辛辣机制的进一步信息。通过半定量 RT PCR 和定量实时 PCR 进一步证实了选定候选物的这种差异蛋白表达。这是世界上最辣的辣椒“Bhut Jolokia”的首次蛋白质组学描述,对这些蛋白质的详细功能分析将提供有关辣椒素这一重要来源的复杂细胞过程和辛辣机制的进一步信息。

 

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