蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

用于从蓝藻发菜 PCC 73102 中分离高丰度藻胆体的自由流电泳分离策略

Nishikant V Wase、Saw Yen Ow、Malinda Salim、Mikkel Nissum、Mike Whalley 和 Phillip C Wright

一般来说，由于存在丰富的蛋白质，蓝藻的蛋白质组学分析的动态分辨率有限。因此，对蓝藻中低丰度蛋白质进行蛋白质组学评估很困难，因为它包含藻胆体和 Rubisco。当前的研究评估了 FFE 在等电聚焦 (IEF) 模式下的性能：一种基于溶液的技术，可根据等电点 (pI) 分离蛋白质。我们探索了使用 FFE 和 1D-LC-MS/MS 结合强大的蛋白质分级分离的优势，通过模型蓝藻、发菜 PCC 73102 的动态范围更深入地扩展蛋白质鉴定。61 种新型蛋白质（248 种（全部与之前的所有报告相比，使用 FFE-IEF 成功鉴定了≥ 2 个肽))。