蛋白质组学与生物信息学杂志
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脊椎动物细胞外硫酸酯酶基因和蛋白的比较和进化研究：SULF1和SULF2

罗杰·S·霍姆斯

细胞外硫酸酯酶（SULF1；SULF2）（EC：3.1.6.-）是硫酸酯酶家族的成员，具有内切葡萄糖胺-6-硫酸酯酶活性，并在蛋白聚糖代谢中发挥重要作用。这些酶调节许多关键的信号传导途径和细胞外空间中糖胺聚糖的硫酸化状态。使用来自多个基因组项目的生物信息数据检查了 SULF1 和 SULF2 氨基酸序列和结构以及 SULF 样基因位置。研究了序列比对和保守二级结构以及关键氨基酸残基和结构域。使用加州大学圣克鲁斯分校基因组浏览器进行比较基因组分析。系统发育研究调查了这些基因和蛋白质的进化关系。人类和其他脊椎动物 SULF1 和 SULF2 序列是保守的，包括信号肽、金属 (Ca2+) 和底物结合序列、活性位点残基和 N-糖基化位点（硫酸酯酶结构域）；和C端带正电荷的亲水结构域。使用细菌磷酸酶结构 (PDB:4UPK) 鉴定了脊椎动物 SULF1 和 SULF2 的硫酸酯酶结构域的预测二维结构。脊椎动物 SULF1 和 SULF2 基因通常分别包含 18/19 或 20 个编码外显子。分别在人 SULF1 和 SULF2 基因启动子和 3'-UTR 区域内鉴定了转录因子结合位点和 miR 结合位点。在 SULF2 启动子中鉴定出雌激素受体基因 (ESR1)，这可能有助于该基因在女性生殖组织中更高的表达水平。SULF1 和 SULF2 基因和蛋白质存在于所有检查的脊椎动物基因组中。