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麦地那龙线虫 MHC 结合肽的计算灵敏定量预测

索努·米什拉 (Sonu Mishra)、维伦德拉·戈马斯 (Virendra Gomase) 和 Karbhari V Kale

“麦地那龙线虫”是麦地那龙线虫病（GWD）的病原体，属于“龙线虫科”家族的成员。长度可达 800 毫米（31 英寸）的传染性雌性线虫是人类麦地那龙线虫病的病原体。独眼巨人是这种传染性寄生虫的中间宿主。健康人饮用或饮用被独眼巨人污染的水，这种水携带有麦地那龙线虫病的传染性幼虫。对于九聚体、抗原肽或特定蛋白质片段的选择，可以进一步用于合理的疫苗设计并增加对免疫系统针对疾病的反应的了解。MHCII（主要组织相容性复合体 II）分析的令人鼓舞的结果表明，麦地那龙线虫病的抗原肽是保护宿主免受寄生虫感染的重要决定因素。在这项研究中，位置特异性评分矩阵 (PSSM) 和支持向量机 (SVM) 算法已用于抗原设计和预测具有 88 个氨基酸长残基（显示 80 个九聚体）的抗原的结合亲和力。抗原与主要组织相容性复合物（MHC）I类和II类分子的结合能力预测将有助于在不久的将来针对麦地那龙线虫病的特异性靶向药物设计。位置特异性评分矩阵 (PSSM) 和支持向量机 (SVM) 算法已用于抗原设计和预测具有 88 个氨基酸长残基（显示 80 个九聚物）的抗原的结合亲和力。抗原与主要组织相容性复合物（MHC）I类和II类分子的结合能力预测将有助于在不久的将来针对麦地那龙线虫病的特异性靶向药物设计。位置特异性评分矩阵 (PSSM) 和支持向量机 (SVM) 算法已用于抗原设计和预测具有 88 个氨基酸长残基（显示 80 个九聚物）的抗原的结合亲和力。抗原与主要组织相容性复合物（MHC）I类和II类分子的结合能力预测将有助于在不久的将来针对麦地那龙线虫病的特异性靶向药物设计。